2004年9月，"广州医学院国家博士后流动工作站"获准建站，我院消化内科被广州医学院定为临床博士后流动工作点，我院消化内科专家李瑜元教授获准成为首批博士后导师。为了博士后流动工作站的建立，我院按有关规定，制定了筹建方案和相关管理规定，由刘朝晖副院长具体负责建站指导工作。
2004年11月12日，来自北京武警医院的薛净博士正式进站工作，至此，标志着我院博士后流动工作站正式建成。
博士后工作站是体现学科学术水平和科研技术水平的核心标志之一。博士后工作站的建立是深入实施人才强省战略，应对日趋激烈的人才竞争的必然要求；是加强高层次人才队伍建设的有效途径；是促进人才工作与经济社会发展相协调的重要手段；是人才开发的一项重要措施。对于加快培养社会主义现代化建设需要的高级专门人才，加强学术交流，增强科研、教学队伍的活力都具有积极意义；并为取得博士学位的人员和用人单位创造更多的相互学习和交流机会，以使人尽其才，才尽其用。对于我院科研学术活动的拓展、丰富、积累及临床科研队伍的成长都具有重要的意义；同时有利于促进我院医、教、研的全面发展。
消化内科博士后工作站的建立将增强该科临床科研、教学队伍保持朝气蓬勃的活力；有利于学术交流，博采众长、加强与科研院校的双向合作，加快科研成果的转化,更好地推进教学研结合，提升消化内科临床科研和创新能力。
我院消化内科（含中医消化内科）是广州市重点学科，科室设备先进，科研硕果累累，在省内外拥有很高的学术地位和水平，是中山大学和广州医学院的博士和硕士培养点。
消化内科的学科带头人、博士导师李瑜元教授是广州市临床医学研究所副所长，是广东省"五个一科技兴医"工程学术带头人，广东省劳动模范，享受国务院政府特殊津贴，广州市管优秀专家。现任中华医学会消化内镜学会全国委员，广东省肝病学会主任委员，广东省新药评审委员，现为国内外12个核心杂志的编委和常务编委。